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課程名稱 |
育種試驗資料分析
Data Analysis for Plant Breeding Experiments |
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開課學期 |
106-2 |
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授課對象 |
生物資源暨農學院 農藝學系 |
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授課教師 |
胡凱康 |
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課號 |
Agron5013 |
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課程識別碼 |
621 U5580 |
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班次 |
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學分 |
3.0 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期四3,4(10:20~12:10) |
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上課地點 |
農藝304 |
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備註 |
星期四5678節實習。與劉力瑜、董致韡、李承叡合授
總人數上限：20人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1062Agron5013 |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
以理論與實作介紹近代分子技術所產生巨量基因體資料的分析方法，並將其運用於作物育種相關操作。
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課程目標 |
1. 從族群演化的觀點切入，討論全基因體關聯分析 (GWAS) 的理論基礎，並培養學生處理相關問題的實作能力；
2. 結合分子標誌技術發展而獲得的大量資料與連續性及非連續性的性狀資料，從距離的概念討論遺傳歧異度在育種程序初期親本選擇上的應用，以及核心種原概念與實務操作。
3. 探討育種程序後期多環境下的品系比較試驗，以及環境效應對於數量基因定位的影響。
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課程要求 |
1. 先修：作物育種學研究法、植物基因體學、統計應用軟體、生物資訊學導論；
2. 具備相當程度的R程式編寫與資料分析能力。
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
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評量方式
(僅供參考) |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
3/01 |
族群遺傳與自然變異(李承叡) |
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第2週 |
3/08 |
族群遺傳與自然變異(李承叡) |
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第3週 |
3/15 |
族群遺傳與自然變異(李承叡) |
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第4週 |
3/22 |
GWAS 原理, 背景介紹 (董致韡) |
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第5週 |
3/29 |
GWAS 資源及操作 (董致韡) |
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第6週 |
4/05 |
春假 |
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第7週 |
4/12 |
GWAS 實作及結果解釋 (董致韡) |
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第8週 |
4/19 |
From variants to genes (董致韡) |
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第9週 |
4/26 |
臺灣農藝學會年會暨研討會（停止上課一次） |
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第10週 |
5/03 |
遺傳歧異度 - SNP ＆ SSR markers |
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第11週 |
5/10 |
基因編輯與作物研究研討會（停止上課一次） |
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第12週 |
5/17 |
核心種原 |
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第13週 |
5/24 |
MET - adaptability |
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第14週 |
5/31 |
MET - sensitivity |
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第15週 |
6/07 |
MET-GGE |
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第16週 |
6/14 |
MET-AMMI |
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第17週 |
6/21 |
GXE in QTL mapping(李承叡) |